引言:《胃肠病学》(Gastroenterology)是美国胃肠病学会(American Gastroenterology Association,AGA)的官方杂志,是国际消化病学领域的顶级学术期刊,提供了胃肠病学基础和临床研究的最新和权威报道。首都医科大学附属北京友谊医院是国家消化系统疾病临床医学研究中心和消化健康全国重点实验室依托单位,是AGA在中国唯一官方指定授权发布《胃肠病学》杂志翻译的单位。
本期为大家带来《狭窄性克罗恩病单细胞RNA测序揭示成纤维细胞异质性和细胞间相互作用》,敬请关注!
狭窄性克罗恩病单细胞RNA测序揭示成纤维细胞异质性和细胞间相互作用
背景与目的
成纤维细胞在克罗恩病(CD)的肠狭窄形成中起关键作用,但仍需要系统水平的研究来发现新的治疗靶点。研究者分析了CD的全层组织,通过构建首个肠道狭窄的单细胞RNA测序(scRNAseq)图谱来揭示成纤维细胞的异质性和功能,并通过试验验证了治疗靶点。
方法
研究者对13例CD患者的新鲜全层切除标本进行了scRNAseq,其中包括无炎症、有炎症无狭窄和狭窄的肠段以及7例非CD的正常肠段。每个肠段被分为黏膜和(或)黏膜下层或固有肌层,并分别分析了共99个组织样本和409,001个细胞。研究者通过组织、分离的肠细胞、NanoString nCounter技术、二代测序、蛋白质组学和动物模型验证了cadherin-11 (CDH11)在CD狭窄中的作用和潜在治疗价值。
结果
综合数据集揭示了狭窄性CD中成纤维细胞的异质性,大多数狭窄特征性改变发生在黏膜和(或)黏膜下层,而不是固有肌层。细胞-细胞相互作用模型显示CXCL14+以及MMP/WNT5A+成纤维细胞在CD狭窄中发挥信号中心的作用。CDH11是一种成纤维细胞间黏附分子,其在狭窄CD组织和成纤维细胞中广泛表达并上调,研究者通过NanoString nCounter、RNA测序、组织靶标表达、体外功能获得和功能丧失试验、蛋白质组学,以及在试验性结肠炎模型中进行基因敲除和抗体介导的CDH11阻断试验证实了CDH11的促纤维化功能。
结论
全层肠scRNAseq图谱揭示了以前未被识别的成纤维细胞异质性及其在CD狭窄中的作用,并验证了CDH11是CD纤维化潜在的治疗靶点。这些结果为更好地了解CD狭窄的形成和开发潜在的治疗手段提供了新的依据。